雞糞中的主要成分是有機質，施用雞糞有機肥可明顯提高土壤中的有機質含量。有機質可以改良土壤物理、化學和生物特性，熟化土壤，培肥地力。施用雞糞有機肥對于改良土壤的作用。施用雞糞有機肥既增加了許多有機膠體，同時還可借助微生物的作用把許多有機物分解轉化成有機膠體，增加了土壤吸附緩沖性能，使土壤顆粒膠結起來變成穩(wěn)定的團粒結構，提高了土壤保水、保肥和透氣的性能，以及土壤自身調節(jié)土壤溫度的能力。但也不能偏面的認為雞糞有機肥施用越多越好。過量施用雞糞有機肥也會同過量施用化肥一樣產生危害，其表現(xiàn)為作物根部吸水困難，易發(fā)生燒根黃葉、僵苗不長、葉片畸形等病狀，嚴重的作物逐漸萎縮而枯死。主要原因是過量施用雞糞有機肥造成土壤中缺水、養(yǎng)分供應不平衡，使土壤中鹽分聚積，硝酸鹽含量超標，從而使作物發(fā)生肥害。

雞糞未經腐熟而直接施用到作物上，存在很大的害處及隱患：直接施在土壤中，在合適條件下發(fā)酵并產生大量的熱量，燒毀作物根系，同時雞糞本身帶有大量病菌，給作物帶來病害隱患。經過發(fā)酵后，一是均衡了有機肥中的酸堿性，減少了硝酸鹽含量，補充了水分，有利與自然界土壤中微生物菌的組合應用;二是發(fā)酵后能殺滅原糞肥中寄生蟲卵、有害生物病菌等，防止雞糞直接給作物和土壤帶來的病菌與危害

雞糞有機肥一般作底肥，地表撒施手隨耕翻深施入土，避免地表撒施現(xiàn)象，減少肥料的損失浪費和環(huán)境污染。

生物肥中的生物菌能加速有機肥中有機物的分解，使其更有利于作物吸收，同時能將有機肥中的一些有害物質分解轉化，避免其對作物造成傷害。雞糞有機肥料與生物菌肥的結合應用，能使土壤具有較好的固氮、解磷、解鉀的功能，起到改良土壤，提高肥料利用率和節(jié)本、增產、增收的效果。

一般情況下，每畝每季菜地的控制量為雞糞有機肥1500—2000千克。果實類和塊莖類蔬菜作物需肥量較大，可取其上限；而綠葉菜類作物需肥量相對較小，可取其下限。